Activité : utilisation de GenieGen2 pour formuler des hypothèses sur les mécanismes d’expression de l’ADN

1. Ouvrir GenieGen2.

2. Cliquer sur "Ouvrir la banque de séquences"

3. Dans la barre de recherche taper "calca"

4. Sélectionner les séquences :

• Gène CALCA (complet)

• Gène CALCA, ARN prémessager

• Gène CALCA, ARNm aboutissant à la protéine calcitonine*

• Gène CALCA, ARNm aboutissant à la protéine CGRP**

* La calcitonine est une protéine qui permet de diminuer le taux de calcium dans le sang en favorisant son stockage dans les os.

** La CGRP est une protéine qui permet de dilater les vaisseaux sanguins et qui participe à la sensation de douleur.

5. Cliquer sur "Charger ces séquences".

Gène CALCA (complet)

1.1. Noter la longueur de la molécule en nombre de nucléotides.

1.2. Noter la séquence de nucléotides contenue entre la position 66 et 80.

1.3. Noter la séquence de nucléotides contenue entre la position 1160 et 1174.

1.4. Noter la séquence de nucléotides entre la position 3539 et 3553.

Gène CALCA, ARN prémessager

1.5. Noter la longueur de la molécule en nombre de nucléotides.

1.6. Noter la séquence de nucléotides entre la position 1 et 15.

1.7. Noter la séquence de nucléotides entre la position 1095 et 1109.

1.8. Noter la séquence de nucléotides entre la position 3474 et 3488.

Gène CALCA, ARNm aboutissant à la protéine calcitonine

1.9. Noter la longueur de la molécule en nombre de nucléotides.

1.10. Noter la séquence de nucléotides entre la position 1 et 15.

1.11. Noter la séquence de nucléotides entre la position 76 et 90.

1.12. Noter la séquence de nucléotides entre la position 487 et 501.

1. Dans GenieGen2, cocher uniquement "CALCA ARNpm" et "CALCA-Calcitonine ARNm".

2. Cliquer sur "Actions" puis "Aligner les séquences".

2.1. Noter le nombre de segments d'ARNpm supprimés dans la molécule d'ARNm.

2.2. Indiquer les positions des nucléotides supprimés.

Protéine calcitonine

3.1. Utiliser le tableau du code génétique pour traduire la séquence de l'ARNm de la calcitonine entre la position 76 et 90.

3.2. Utiliser le tableau du code génétique pour traduire la séquence de l'ARNm de la calcitonine entre la position 487 et 501.

Comme nous l'avons vu, l'expression du gène CALCA permet la production de la protéine calcitonine (qui permet de diminuer le taux de calcium dans le sang en favorisant son stockage dans les os).

Mais l'expression du gène CALCA permet aussi la production d'une autre protéine, la protéine CGRP (qui permet de dilater les vaisseaux sanguins et qui participe à la sensation de douleur).

1. Dans GenieGen2, cocher uniquement "CALCA ARNpm" et "CALCA-CGRP ARNm".

2. Cliquer sur "Actions" puis "Aligner les séquences".

4.1. Noter le nombre de segments d'ARNpm supprimés dans la molécule d'ARNm.

4.2. Indiquer les positions des nucléotides supprimés.

4.3. Utiliser le tableau du code génétique pour traduire la séquence de l'ARNm de la CGRP entre la position 76 et 90.

4.4. Utiliser le tableau du code génétique pour traduire la séquence de l'ARNm de la CGRP entre la position 448 et 462.